У меня украли деньги со счета в банке. Должен ли банк компенсировать мне вклад?

Непонятно из Вашего вопроса, если организация - банкрот, то у нее не может быть правопреемника. Может Ваша организация находиться не в процедуре банкротства, а реорганизации?

Если действительно организация признана банкротом, то Вы должны обращаться к арбитражному управляющему, чтобы Ваши требования были включены в реестр требований кредиторов.

Этот вопрос урегулирован ФЗ "О несостоятельности (банкротстве)", в соответствии с которым при расчетах с кредиторами в первую очередь производятся расчеты по требованиям граждан, перед которыми должник несет ответственность за причинение вреда жизни или здоровью, путем капитализации соответствующих повременных платежей, компенсации морального вреда, а также расчеты по иным установленным настоящим Федеральным законом требованиям; во вторую очередь производятся расчеты по выплате выходных пособий и оплате труда лиц, работающих или работавших по трудовому договору, и по выплате вознаграждений авторам результатов интеллектуальной деятельности; в третью очередь производятся расчеты с другими кредиторами.

Если денег недостаточно для удовлетворения требований всех кредиторов одной очереди, то в этом случае денежные средства распределяются пропорционально между всеми такими кредиторами.

Вам необходимо обратиться к арбитражному управляющему для включения Ваших требований в реестр кредиторов.Процедура банкротства может быть достаточно длительной, вплоть до нескольких лет (зависит от крупности компании).

Процедура банкротства несколько затянет процесс получения денежных средств. При этом она не гарантирует получение денег, так как их может не хватить даже на должников второй очереди.

Реестр требований кредиторов подлежит закрытию по истечении двух месяцев с даты опубликования сведений о признании должника банкротом и об открытии конкурсного производства.
Требования кредиторов первой очереди, заявленные до окончания расчетов со всеми кредиторами (в том числе после закрытия реестра требований кредиторов), но после завершения расчетов с кредиторами первой очереди, заявившими свои требования в установленный срок, подлежат удовлетворению до удовлетворения требований кредиторов последующих очередей. До полного удовлетворения указанных требований кредиторов первой очереди удовлетворение требований кредиторов последующих очередей приостанавливается.
В случае, если такие требования были заявлены до завершения расчетов с кредиторами первой очереди, они подлежат удовлетворению после завершения расчетов с кредиторами первой очереди, заявившими свои требования в установленный срок, при наличии денежных средств на их удовлетворение.
Требования кредиторов второй очереди, заявленные до окончания расчетов со всеми кредиторами (в том числе после закрытия реестра требований кредиторов), подлежат удовлетворению в порядке, аналогичном для требований кредиторов первой очереди и так далее.

 Заявление правопреемника - СБ РФ о расследовании должно быть подтверждено документально. Вам обязаны предоставить - копию заявления банка в суд по факту кражи денег, процессуальные документы по данному факту-например, Постановление о возбуждении уголовного дела, или иные документы, а также Постановление о признании потерпевшим банк. Если таких документов Вам не представлено, необходимо подать заявление в полицию с описанием Ваших действий (обратились, Вам заявили, что ведется расследование, а Вам ничего не известно, просите сообщить, поступало ли заявление, приняты ли процессуальные решения, ..... и т.д.). Если информация о расследовании не будет официально подтверждена - подавайте заявление сначала в банк о возврате денег, а затем в полицию с просьбой установить, куда делись деньги со счета, и в случае, если имеются признаки преступления, возбудить уголовное дело. ВСЕ ДОКУМЕНТЫ везде официально регистрировать, устных переговоров не вести - все только письменно. Потом, после получения всей информации принимать решение дальше - что делать. Удачи.